科研试验需要研究水稻中某一基因的功能,请详述获得该基因的序列并进行序列分析及其所编码蛋白质结构与功能分析的过程。
1、获取DNA目标序列 通过GenBank或欧洲分子生物学实验室数据库等数据库查找目标序列(1分)。2、查找开放阅读框 利用ORF分析软件查找ORF并将DNA序列翻译成蛋白质(1分)。3、在数据库中进行序列搜索 利用BLAST进行ORF核苷酸序列和ORF翻译的蛋白质序列搜索。 (2分)。 4、将目标序列与搜索得到的相似序列进行全序列比对(global squence alignment),进一步加深对目标序列的分析(2分)。 5、查找基因家族 进行多重序列比对(multiple sequence alignment)和获得比对区域的图形信息。这种比对可分别在英国AMAS和瑞士BOXSHADE等服务器上进行。 (2分)6、查找目标序列中的特异模序结构 先分别在Prosite、模块(block)、模序(motif)数据库进行检索,然后对蛋白质序列进行结构统计分析和有关功能的预测。 (2分)。7、预测目标序列结构 利用Predict Protein、NNPREDICT等工具预测目标序列的蛋白质二级结构(2分)。 8、获取相关蛋白质的功能信息 利用PubMed搜索与目标序列和结构相似蛋白质的功能信息相关的文献资料(2分)。
举一反三
- 多基因家族中，某些基因序列与具有编码功能的基因序列相似，但不能编码蛋白质，这类基因称为_
- 基因组计划的基本目标是（ ）。 A: 获得蛋白的基因编码序列，在此基础上对该蛋白结构进行研究 B: 获得全基因组序列，在此基础上再对所获得的序列进行解读 C: 获得蛋白的基因编码序列，在此基础上对该蛋白功能进行研究 D: 获得全基因组序列，在此基础上再对每个基因编码蛋白的功能及结构进行研究
- 结构基因是指基因中编码蛋白质的DNA序列
- 基因的沉默突变会导致 A: 该基因编码的蛋白将不表达 B: 由该基因编码的mRNA核苷酸序列不发生改变 C: 由该基因编码的蛋白质氨基酸序列不发生改变 D: 该基因编码的蛋白中某个氨基酸会被另一氨基酸替代，但不会导致蛋白功能的改变
- 基因的沉默突变会导致 A: 由该基因编码的mRNA核苷酸序列不发生改变 B: 由该基因编码的蛋白质氨基酸序列不发生改变 C: 该基因编码的蛋白将不表达 D: 该基因编码的蛋白中某个氨基酸会被另一氨基酸替代，但不会导致蛋白功能的改变
内容
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真核细胞中的结构基因中,无编码功能的序列称为,
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请从数据库中下载基因的CDS序列，并进行序列分析。训练要点： 1、基因CDS区序列下载(具体基因任选)；2同源基因分析(BLAST)；3多序列比对；4分子进化分析(MEGA)
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如果知道某一基因的功能及其相应的蛋白质的氨基酸序列组成，可以通过何种方法克隆该基因
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基因组实际上包括编码蛋白质的结构基因，以及目前功能还尚不清楚的（ ）。 A: RNA序列 B: DNA序列 C: 调控序列 D: 操纵子序列
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基因序列分析一般需要借助软件进行